Por meio de ofício datado de 20 de maio de 1996, a Associação de Ensino Superior de Osvaldo Cruz, entidade mantenedora, deu entrada no CNE (Conselho Nacional de Educação) com o pedido de instalação da Faculdade de Educação de Osvaldo Cruz (FEOCRUZ), através dos projetos dos cursos de Pedagogia e de Letras. Estas solicitações receberam os números de processo 23.000.005.870/96-78 e 23.000.005.871/96-31, respectivamente.

Pela Portaria Ministerial nº. 260/97 SESu/MEC foi determinada a Comissão Verificadora para o curso de Pedagogia, formada pela Profª. Dra. Iria Brzezinski, Profª. Dra. Ilma Passos Alencastro Veiga e Rosana Louro Ferreira Silva, especialista do MEC, cujo trabalho foi realizado nos dias 13 e 14 de novembro de 1997. Foi obtida boa pontuação e recomendação para a instalação do curso. Também foi designada, posteriormente, a Comissão Verificadora para o  curso de Letras, que aprovou a sua instalação.

Posteriormente, através da Portaria Ministerial nº. 373 de 8 de maio de 1998, publicada no Diário Oficial da União (D.O.U.) de 11/05/98, foi autorizado finalmente o funcionamento do curso de Pedagogia, com 120 vagas anuais.

No mês seguinte, através da Portaria Ministerial nº. 567, de 26 de junho de 1998, publicada no D.O.U. de 29/06/1998, foi autorizada a implantação do curso de Letras, com habilitação em Língua Portuguesa e Língua Inglesa e respectivas Literaturas, com 80 vagas anuais.

O primeiro processo seletivo da Faculdade  (vestibular) foi realizado em julho de 1998, somente para o curso de Pedagogia, para ingresso de 45 alunos iniciantes, com o primeiro  período letivo iniciando-se em 8 de agosto de 1998. Tal curso foi reconhecido pela Portaria Ministerial nº. 838, de 22 de março de 2002, publicada no D.O.U. de 27/03/2005.

O primeiro vestibular para o curso de Letras foi realizado no final de 1998, iniciando o curso  em 1999.

Sem prédio próprio, a Faculdade de Educação de Osvaldo Cruz, em seu princípio, funcionou na Escola de 1o. e 2o. graus “Posicruz”, de agosto de 1998 a julho de 2000, quando já estava construído o seu prédio próprio, com cerca de 6.000 m², junto à  Rua Chile, 501, Bairro Jardim das Bandeiras, com totais condições de recebimento de todas as suas turmas.

Pela Portaria Ministerial nº. 838, de 22 de março de 2002, publicada no D.O.U. de 27/03/2005, o curso de Pedagogia foi reconhecido pelo prazo de 4 anos. Posteriormente, através da Portaria Ministerial nº. 2.280, de 03 de agosto de 2004, o curso de Letras foi reconhecido por 5 anos. 

O curso de Administração, com habilitação em Gestão de Negócios, passou a funcionar em 2000, autorizado pela Portaria Ministerial  nº. 1298  de  23 de agosto de 2000, publicada no D.O.U. de 24/08/2000, com 100 vagas anuais. Atualmente, o curso já tem duas turmas formadas, a primeira em julho de 2004 e a segunda, em dezembro de 2004. Já recebeu comissão do MEC para avaliação do processo de reconhecimento. O curso foi reconhecido e está sendo aguardada a publicação no D.O.U., da portaria que confirma tal reconhecimento, para todo o território nacional. 

Em 23 de dezembro de 2003 foi autorizado, através de publicação no D.O.U. da Portaria Ministerial nº. 3.938, de 18/12/2003,  o funcionamento do curso Normal Superior, com as habilitações Licenciatura para os Anos Iniciais do Ensino Fundamental, com 100 vagas anuais, e Licenciatura para a Educação Infantil, também com 100 vagas anuais. Tal curso passou a funcionar submetido ao Instituto Superior de Educação, novo órgão da Faculdade de Educação de Osvaldo Cruz, responsável pelos cursos de formação de professores, onde se encaixa também o curso de Letras. 

O curso Normal Superior então passou a ser o responsável pela formação de pedagogos que irão lecionar, enquanto o curso de Pedagogia ficou responsável pela formação de administradores e supervisores escolares.

Em 2004, foi criado o Centro de Pós-Graduação da Faculdade de Educação de Osvaldo Cruz, o Centro de Pesquisas em Educação e o Centro de Pesquisas em Administração. Posteriormente, por meio de decisão dos órgãos colegiados da Faculdade, decidiu-se pela implantação do curso de Pós-Graduação “Lato Sensu” em Psicopedagogia, com duração de 11 meses. Tal curso é voltado à capacitação de profissionais da área da educação no que tange ao trabalho com alunos portadores de deficiências ou disfunções que exijam cuidados especiais quanto ao processo de ensino-aprendizagem.

Em agosto de 2004, após também decisão dos órgãos colegiados da Faculdade, levando-se em conta a demanda apresentada pela cidade de Osvaldo Cruz e Região, decidiu-se pela implantação do curso de Pós-Graduação “Lato Sensu” e M.B.A. (Master in Business Administration) em Gestão Estratégica e de Marketing. Tal curso é voltado a administradores e gestores de negócios em geral que anseiam por uma formação executiva completa, mas com atenção especial voltada para a área de marketing e planejamento estratégico. Como importante novidade, está sendo lançado em maio de 2007, o curso de Pós-Graduação “Lato Sensu” e M.B.A. em Gestão Ambiental, importante marco na expansão dos cursos de Pós-Graduação da área de Administração. Tal curso é voltado a administradores, professores de ensino fundamental, médio ou superior, geógrafos, geólogos, biólogos, engenheiros, economistas, arquitetos e demais profissionais de áreas afins.

Todos os cursos da FEOCRUZ, tanto na área da graduação como da pós-graduação, no que tange ao ensino, intentam ser considerados como de ponta e, para desempenhar essa vocação, propõe-se seguir um conjunto de princípios em direção à qualidade de ensino, destacados abaixo:

1º) O aluno como razão de ser da Faculdade;

2º) Capacitação intensiva e constante de seus recursos humanos, desenvolvendo modernas técnicas pedagógicas e didáticas e estimulando os seus professores a um contínuo processo de aperfeiçoamento;

3º) Desenvolvimento de cursos e técnicas pedagógicas, cabendo ao professor conhecer profundamente sua disciplina e, também, as melhores técnicas e processos para ministrá-la;

4º) Avaliação sistemática do esforço educacional, no sentido de se obter um aperfeiçoamento constante e duradouro a médio e longo prazo;

5º) Utilização permanente de técnicas qualitativas e quantitativas para a medição dos resultados obtidos;

6º) Utilização da informática como instrumento de ensino e suporte às demais atividades;

7º) Abertura para o mundo, promovendo a execução de convênios com centros de excelência universitária absorvendo as mais modernas experiências, adaptando-as à realidade regional;

8º) Investimento em instalações físicas, bibliotecas e demais instrumentos que proporcionem condições adequadas ao ensino de qualidade;

9º) Desenvolvimento de condições de reconhecimento por parte da comunidade para que seus concursos vestibulares sejam procurados por um elevado número de candidatos e, como conseqüência, seleção seja pautada pela qualidade;

10º) Busca de parcerias com empresas e instituições, procurando conscientizá-las de que a qualificação profissional começa na Escola.

O principal compromisso da Feocruz é com o aluno e, indiretamente, (com o mercado. Todas as suas ações são orientadas para a facilitação do aprendizado para a formação de profissionais com consciência crítica de suas responsabilidades, visão holística e comprometimento social e ambiental. 

Busca-se a qualidade em tudo o que é feito, desde o planejamento das atividades, dos materiais de apoio, dos instrumentos de avaliação, até os procedimentos pedagógicos, dos mais complexos aos mais elementares.

A Faculdade, através de sua direção e demais profissionais, tem empreendido significativos esforços a fim de estabelecer estreitos laços e relacionamentos com a comunidade local e regional. Diversas atividades têm contribuído com o desenvolvimento, como por exemplo, a oferta sistemática de palestras, seminários e semanas de estudos, promoção de incentivos visando melhor formação e qualificação de professores, utilização plena dos recursos tecnológicos, investimentos periódicos na biblioteca, entre outros.